اكتشف الباحثون ما يقرب من 2000 بكتيريا أمعاء جديدة
وفقًا للعديد من الدراسات الحديثة ، فإن مجموعات بكتيريا الأمعاء البشرية قادرة على التأثير على جوانب مختلفة من صحتنا الجسدية والعقلية. على الرغم من ذلك ، تظل العديد من البكتيريا "غير محددة" من قبل العلماء. كشفت دراسة جديدة الآن عن حوالي 2000 بكتيريا أمعاء غير معروفة سابقًا.
الدراسات الحديثة التي تغطيها أخبار طبية اليوم أظهروا أن ميكروبيوتا الأمعاء يمكن أن يكون لها دور في مرض باركنسون والخرف ، وقد يفسرون سبب نجاح أدوية السكري من النوع 2 مع البعض ولكن ليس للبعض الآخر.
بحث جديد - ظهر أمس في المجلة طبيعة سجية - حدد الآن ما يقرب من 2000 نوع جديد من بكتيريا الأمعاء التي لم يسبق للعلماء تربيتها في المختبر من قبل.
استخدم فريق الباحثين ، من المعهد الأوروبي للمعلومات الحيوية (EMBL-EBI) ومعهد ويلكوم سانجر ، وكلاهما في هينكستون بالمملكة المتحدة ، التحليل الحسابي لتقييم عينات ميكروبيوم الأمعاء من المشاركين من جميع أنحاء العالم.
يوضح مؤلف الدراسة Rob Finn ، من EMBL-EMI: "تسمح لنا الأساليب الحسابية بفهم البكتيريا التي لا يمكننا زراعتها في المختبر بعد".
"إن استخدام علم الميتاجينوميات [تحليل المادة الجينية] لإعادة بناء الجينوم البكتيري يشبه إلى حد ما إعادة بناء مئات الألغاز بعد خلط كل القطع معًا ، دون معرفة الشكل الذي يجب أن تبدو عليه الصورة النهائية ، وبعد إزالة بضع قطع تمامًا من تخلط فقط لجعل الأمر أصعب قليلاً "، يتابع.
ومع ذلك ، يضيف فين ، "الباحثون الآن في مرحلة يمكنهم فيها استخدام مجموعة من الأدوات الحسابية لتكملة عمل المختبر وتوجيهه في بعض الأحيان ، من أجل الكشف عن رؤى جديدة في القناة الهضمية البشرية."
نهج جديد
تمكن الفريق من إعادة بناء 92143 جينومًا من عينات من 11850 ميكروبيوتا معوية متنوعة.
سمح ذلك للباحثين بتحديد 1952 نوعًا من بكتيريا الأمعاء التي لم يعرفوها هم وآخرون حتى هذه النقطة.
يشرح فين وزملاؤه أن العديد من الأنواع البكتيرية "حافظت على مكانة منخفضة" ، إذا جاز التعبير ، لأن العلماء وجدوها فقط بأعداد قليلة جدًا في القناة الهضمية ، أو أنها لا تستطيع البقاء خارج بيئة الأمعاء.
وأشاروا إلى أن هذا منع العلماء حتى الآن من إضافة مثل هذه الأنواع إلى قائمة بكتيريا الأمعاء التي يعرفون عنها. هذا هو السبب أيضًا في أن الفريق الذي أجرى الدراسة الحالية قرر اتخاذ طريق جديد - واستخدام مجموعة من الأساليب الحسابية لمحاولة التوصل إلى "خريطة" أكثر شمولاً للميكروبات البشرية.
يقول ألكسندر ألميدا ، مؤلف مشارك في الدراسة: "تسمح لنا الأساليب الحسابية بالحصول على فكرة عن العديد من الأنواع البكتيرية التي تعيش في أمعاء الإنسان ، وكيف تطورت ، ونوع الأدوار التي قد تلعبها في مجتمعها الميكروبي".
نحو إنشاء "مخطط متين"
يوضح ألميدا: "في هذه الدراسة ، استفدنا من قواعد البيانات العامة الأكثر شمولاً للبكتيريا المعدية المعوية لتحديد الأنواع البكتيرية التي لم يتم رؤيتها من قبل. إن طرق التحليل التي استخدمناها قابلة للتكرار بدرجة كبيرة ويمكن تطبيقها على مجموعات بيانات أكبر وأكثر تنوعًا في المستقبل ، مما يتيح المزيد من الاكتشاف ".
يأمل الباحثون في المستقبل أن تساعد هذه الدراسة والدراسات المماثلة في فهمهم للأمعاء البشرية ، والتي بدورها ستساهم في تطوير علاجات أفضل لمجموعة متنوعة من الحالات.
"يساعدنا بحث مثل هذا في إنشاء ما يسمى بمخطط الأمعاء البشرية ، والذي ، في المستقبل ، يمكن أن يساعدنا في فهم صحة الإنسان والمرض بشكل أفضل ويمكنه حتى توجيه تشخيص وعلاج أمراض الجهاز الهضمي."
شارك في الدراسة تريفور لولي ، من معهد ويلكوم سانجر
في الوقت نفسه ، لاحظ الفريق أن الدراسة الحالية جعلت الباحثين أكثر وعيًا بوجود فجوة كبيرة في البحث حول بكتيريا الأمعاء.
يؤكد الباحثون أن العلماء يعرفون حاليًا القليل نسبيًا عن الأنواع البكتيرية التي تتميز بها مجموعات سكانية أخرى غير تلك التي تعيش في أوروبا وأمريكا الشمالية.
"إننا نشهد ظهور الكثير من نفس الأنواع البكتيرية في البيانات المأخوذة من سكان أوروبا وأمريكا الشمالية. ومع ذلك ، فإن مجموعات البيانات القليلة في أمريكا الجنوبية وأفريقيا التي كان لدينا وصول إليها لهذه الدراسة كشفت عن تنوع كبير غير موجود في السكان السابقين ، "يلاحظ فين.
ويضيف قائلاً: "يشير هذا إلى أن جمع البيانات من المجموعات السكانية الممثلة تمثيلاً ناقصًا أمر ضروري إذا أردنا تحقيق صورة شاملة حقًا لتكوين الأمعاء البشرية" ، وحث الباحثين على الاستمرار في التركيز على مجموعات أكثر تنوعًا ، والمضي قدمًا.
